por que no pruebas concatenar? es decir....
en el ciclo en vez de llamar al query, simplemente metes en una variable separadas por comas los 3200 registros y luego haces un in
Código:
WHERE NCedulas IN (' $TuVariable ')
algo así...
si el problema es la cantidad, tambien puedes pasar los parámetros por temporales..
saludos!