Puedes hacerlo como lo planteas te doy una idea a ver si te sirve:
Creas tu formulario de login y le agregas dos controles tipo radio Administrador y Usuarios
Código HTML:
<input type="radio" name="criterio" value="administrador">Administrador
<input type="radio" name="criterio" value="usuario">Usuario
Y en tu página de proceso realizas las busqueda a las diferentes tabla dependiendo de la opción seleccionada algo asi:
Código PHP:
if($_POST['criterio'] == "administrador")
{
// realizas la validación de datos en la tabla administrador
}
elseif($_POST['criterio'] == "usuario")
{
// realizas la validación en la tabla usuarios.
}
Saludos.