Te falla en que tu no puedes hacer esto:
Código PHP:
$destinatario = "<script> document.write(mus) </script>";
Eso lo que hace es le asigna a $destinatario la variable <script> document.write(mus) </script>, no el resultado del document.write, por lo que nunca te va a evaluar a si o no.
Aunque tu lo imprimas con echo $destinatario, te va a imprimir <script> document.write(mus) </script>, que si lo ves en el explorador lo evalua como html y te muestra el si o no.
Si tu deseas pasar el valor necesitas enviarlo vía un formulario (via GET o POST), o si no deseas cambiar la pagina usando AJAX.
Saludos.