Bastante extraña tu situación, por lo general cuando ves que tu site no cambia es por que tu navegador tiene una copia del site en el disco, lo que llamamos "cache", ahora si no has configurado ningún "meta expire" en tus páginas y los archivos los puedes ver por ftp y aún así sigues viendo una versión anterior puede tratarse de un ajuste del server que está mostrando la "cache" de tu página. Para descartar el tema de tu alojamiento prueba con uno gratuito y realiza modificaciones para que confirmes si el problema no es de ellos.
Suerte y luego nos comentas como te fue.