hola..
mira el reporte de HJT no muestra infeccion alguna solo que tienes activado en el inicio este ejecutable:
O4 - HKLM\..\Run: [Alcmtr]
ALCMTR.EXE
como puedes ver en el enlace en la descripcion de castlecops se indica que ese archivo no es de malware ya que se instala junto a los drivers de las tarjetas realtek pero ese ejecutable en especifico lo que hace es monitorear tu equipo y recoger info sobre ella.
del resto HJT no muestra infeccion alguna, si has realizado scan con varios antivirus y antispywares sin que te hayan encontrado nada, en lo personal descartaria que el problema se deba a infeccion, desde cuando estas teniendo ese problema? que programas o cambios realizaste en tu equipo antes de presentar el problema?
como bien te comento
frins89 la solucion podria ser restaurar el equipo a un punto anterior al problema, lo unico seria que perderias cualquier software que hayas instalado desde ese momento hasta hoy pero no perderas ninguna informacion o documentos personales..