creo q no se puede poner un condicional dentro del echo..... pero si lo q kieres es no poner 2 echo.. saca la condicion fuera del echo, le asignas los valores a una variable, y en el echo solo lo q harias es colocarla en lugar del if...
if($procesado=='P')
$valor = "<a href=\"../devolucion/fprocesar_devolucion.php?cedula=$cedula\">Aplicar Pago</a></font></td>";
else
$valor = "Aplicar Pago</font></td>";
echo ("
<td width=\"400\" height=\"25\" align=\"left\">
<p style=\"margin-left: 5px; margin-right: 5px\">
<font face=\"Arial\" style=\"font-size: 9pt\" color=\"#666666\">$comentario
</font></td>
$valor
<td width=\"105\" height=\"25\" align=\"left\">
<p style=\"margin-left: 5px; margin-right: 5px\">
<font face=\"Arial\" style=\"font-size: 9pt\">
<td width=\"50\" align=\"center\" height=\"25\">
<p style=\"margin-left: 5px; margin-right: 5px\">
<a href=\"fmodifica.php?id=$id\">
<img border=\"0\" src=\"../../images/edit.gif\" width=\"19\" height=\"19\"></a></td>")