hola, aqui te dejo un link que explica muy bien lo que debes hacer, espero lo entiendas:
http://www.mysql-hispano.org/page.php?id=27&pag=1
pero bueno, si usas phpmyadmin y tus tablas son InnoDB es muy facil, solo creas las tablas y despues te fijas, tienes un link que dice vista de relaciones, alli solo tienes que crear la relacion que deseas, pero ojo, los campos a relacionar deben ser llaves (KEY)
saludos y suerte