Para asegurarte de que eso no ocurra, llamá a window.print() desde el evento onload del tag body de la página a imprimir. Ejemplo:
Código PHP:
<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD XHTML 1.0 Transitional//EN" "http://www.w3.org/TR/xhtml1/DTD/xhtml1-transitional.dtd">
<html xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml">
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=iso-8859-1" />
<title>test</title>
<script>
function abrir(){
ventana=window.open('','','width=500,height=200');
ventana.document.open();
ventana.document.write("<html><head></head><body onload=\'window.print();window.close();\'>algo</body></html>");
ventana.document.close();
}
window.onload=function(){document.getElementById('ppp').onclick=abrir;}
</script>
</head>
<body>
<p id="ppp">abrir</p>
</body>
</html>