Hgan lo que se les dijo mas arriba:
1.- Checar que su PC o su red de que No esten infectados.
2.- Cambiar atributos de los archivos de los archivos index de 777 a 644 mediante chmod.
3.- Cambiar usuarios y passwords de Cpanel y FTP.
4.- Checar todas las carpetas en busca de archivos index que esten infectados ejemplo:
www/index.html
www/folder1/index.html
www/fodler2/index.html
www/.../index.html
Para que se aclaren comn esto de los permisos 644 :
http://www.wikilearning.com/tutorial...rmisos/6515-28
Saludos, y si seguimos esos pasos, sobre todo de los permisos no tendria por que modificarnos los archivos en el servidor, por supuesto los que usen apache.