Bueno, este mundo de la Multimedia esta dominado por PC y MAC, es muy pero muy raro que alguien pregunte sobre Linux, debido a que los programas de edición Semi Pro y Pro corren sobre Win o Mac, y usar terminales como las que comentas se dan en casos muy muy raros... Por ejemplo, para esto de los FLV, se puede usar un programa gratuito llamado SUPER (que no instala bichos) para hacer eso que necesita el usuario, como usualmente se trabaja en Win o Mac, pues lo usan, no van de Win usando Vegas a Linux usando consola para ajustar el bitrate de un archivo y regresar nuevamente a Win para seguir editando...
Sería bueno que si aportas una solución en este mundo multimedia explicarás que tienes una alternativa usando Linux
(algo así como: "En Linux, en la terminal escriben lo siguiente:...")