En primer lugar, actualízate a Fedora 8. Ten en cuenta que Fedora Core 3 dejó de recibir soporte hace ya un par de años.
En segundo lugar, lee
http://docs.fedoraproject.org/releas...Kernel-Flavors para que sepas cómo preparar tu sistema para compilar módulos del kernel (básicamente consiste en ejecutar "yum install kernel-devel" y punto).