en javascript no puedes llegar al sistema, ya que se ejecuta en maquina cliente, ademas de por motivos de seguridad, lo que si puedes hacer es que al pulsar el boton te vaya a otra pagina que haga el susodicho proceso, eso si mediante leguanje de servidor: perl, php, asp, jsp, etc....
Tambien podrias hacerlo mediante ajax, si quieres hacerlo de esta manera pasate por el foro 77:
http://www.forosdelweb.com/f77/
;)