He probado ahora a eliminar las 2 primeras entradas de assemblies:
<add assembly="System.Web.Extensions, Version=1.0.61025.0, Culture=neutral, PublicKeyToken=31BF3856AD364E35"/>
Línea 36: <add assembly="System.Web.Extensions.Design, Version=1.0.61025.0, Culture=neutral, PublicKeyToken=31BF3856AD364E35"/>
y me funciona la aplicación en principio correctamente. Pero no se si esto puede traer algún tipo de efecto secundario.