Por poco ni ten entiendo.
lo único que tienes que hacer es hacer un link en el head de tu html del codigo javascript, por ejemplo:
Código HTML:
<script type="text/javascript" src="scripts/swfobject.js"></script>
En este caso scripts/swfobject.js es la ruta donde se encuentra. Luego creas un elemento contenedor donde quieres que vaya el flash. Yo uso un div. a ese div le pones un id único (bueno, todos los id son únicos) y también pones lo que el usuario vería si no tiene javascript activado, por ejemplo:
Código HTML:
<div id="contenido_flash">información alterna que se mostrara al usuario que no tenga javascript habilitado</div>
Después de este div pones el código javascript que lo que hará es remplazar lo que está dentro del div:
Código HTML:
<script type="text/javascript">
var so = new SWFObject("archivo.swf", "Archivo", "900", "222", "8", "#FFFFFF");
so.write("contenido_flash");
</script>
En este código vas a cambiar lo siguiente por tu información:
"archivo.swf" - la ruta donde está tu archivo
"Archivo" - El título que tenga el archivo
"900" - el ancho en píxeles de tu archivo swf
"222" - el alto en píxeles de tu archivo swf
"8" - La versión de flash que quieras usar
"#FFFFFF" - El color de fondo que quieras usar
Y eso es todo.