Hola:
Espero que no adoptes la costumbre de hacer esas chorradas en una página... son de esas cosas que han desprestigiado el lenguaje.
Como respuesta:
var temporizador = null;
function hora() {
ya = new Date();
hh = ya.getHours();
mm = ya.getMinutes();
ss = ya.getSeconds()
window.status = hh + ":" + mm + ":" + ss;
}
<body onload="temporizador = setInterval('hora()', 1000')" >
...
Y en el botón:
<button type="button"
onclick="if (temporizador != null) {clearInterval(temporizador); temporizador = null} else temporizador = setInterval('hora()', 1000)">...
Saludos
