Cita: Lo que quiero saber es si las 10 rutas más cortas de la tabla rutas_100 coinciden con las de rutas_10.

De las 10 rutas más cortas de un origen-destino de rutas_100 (un select Top 10 ordenado por distancia desc) ... ¿quieres que se muestren las que coincidan (inner join) o las que no se encuentren (not exists)?