Me pueden penalizar por esto?

[aloqui]

Si lo que pretendes es que en el codigo HTML aparezca antes antes una tabla A que una tabla B. La solucion con javascript de intercambiar el contenido de ambas tablas no es aplicable, porque con el solo modificarias la estuctura del objeto DOM, y los spiders lo que cogen es el codigo HTML y no el objeto DOM (con o sin modificaciones).