Hola feral. Puedes crear dentro de "www" tantas carpetas como quieras y dentro de esas carpetas poner distintos sitios web. Es decir:
Pues tener dentro de "www" una carpeta llamada web1, y dentro de esa carpeta web1 meter todos tus scripts.
Luego puedes crear otra carpeta llamada web2,y dentro de esa carpeta web2 meter todos sus respectivos scripts.
Y así sucesivamente con todas tus webs.
Lo unico que tendras que hacer luego es indicarle en el navegador la ruta adecuada, es decir:
por ejemplo:
http://localhost/web1/index.php
o por ejemplo:
http://localhost/web2/menu.php
Espero haberte ayudado y haber entendido tus necesidades
;)