Ahí es donde está tu error, phpMyAdmin, no te va a permitir realizar ese proceso con tanta información.
Para eso mejor hacelo con mslqdump
Backup MySQL con mysqldump, ahí está tu respuesta bien explicada, así que lee con cuidado.
Otra cosa, mira que iniciaste diciendo migrar de Access a SQL usando ODBC, ahora estas con otra cosa completamente diferente, si no sos claro en lo que estas haciendo, la ayuda que vas a obtener va a errada