hola
esa pasta térmica sirve para mejorar la unión entre el cooler y el micro, de no ser así el peligro de que aumente la temperatura y por tanto disminuya la vida del micro, es importante.
esta pasta se encuentra normalmente sin problemas en tiendas de informática. aquí te dejo un artículo que explica como aplicarla:
http://www.clubedohardware.com.br/artigos/1126 está en portugués, pero espero que no tengas problemas por ello. si hay algo que no entiendes no tienes más que decírmelo.
si como dices el cooler hace mucho ruido quizá te convenga un cambio del mismo porque cuando empiezan con el ruido suele ser síntoma de un cambio a un plazo más o menos corto. los nuevos coolers suelen traer una ligera capa de pasta.
un saludo