Claro que si, mira:
Creas la ventana con la que le pasaras los parametros:
Código PHP:
<input type="button" value="Agregar Evento" onclick="ventanita = window.open('formulario.php?id_evaluado=<?= $id_evaluado ?>&id_evaluador=<?=$id_evaluador?>','ventanita','width = 450,height = 330');" />
con eso le pasas una variable llamada id_evaluado e id_evaluador
y en la pagina formulario.php
haces un GET de las variables ejemplo
Código PHP:
$id_evaluado = $_GET['id_evaluado'];
$id_evaluador = $_GET['id_evaluador'];
Saludos
Guillermo