intentá usar el 
IE7 script que hace que IE6 se comporte algo mejor en cuanto a su  aceptación de estándares, capaz se soluciona. 
El problema viene que el IE6 no da soporte para z-index en los selects... puedes buscar en google y verás que es un tema recurrente. Leí por ahí que tambien se puede solucionar dandole al elemento padre del select lo siguiente: 
 Cita:  position:relative;z-index:1
    pero no siempre funciona..