Hola:
Ese "+ cual +" no sirve si no es un evento (onXXXXX)
Creo que sería mejor que usaras un id en el embed (y donde tengas que hacer modificaciones), y asignes todos ese "src" en la función...
Código:
function origen(cual){
alert('El Valor de cual es: '+cual+'.');
document.getElementById('misitio').style.visibility='visible';
document.getElementById('el_embed').src = "http://www.youtube.com/v/"+cual+"&rel=1" ;}
Creo que te falta algún tag object...
Saludos
