Hmm, de hecho las dependencias de cada programa son las mismas, independientemente de qué escritorio tengas. Lo que es probable que cuando instalaste sobre KDE ya tenías satisfecho algunas dependencias de Audacity.
Todo depende de lo que quieras:
KDE = Muchísimas opciones y control completo sobre las configuraciones de tu sistema.
GNOME = Menos opciones gráficas de configuración que KDE, pero prácticamente el mismo rendimiento.
XFCE = Mas simple, muchas menos opciones de configuración gráfica que los otros dos, pero mucho más liviano y a mi gusto más bonito. Con 128 Mb de ram XFCE se siente ligero, con 512 ¡Vuela!
