Hola,
En una ocasión hice una limpieza no tan profunda, abrí el Case y lo aspire porque tenia demasiado polvo, también cambie el cable que va desde el botón de encendido hasta la MoBo porque el conector estaba como defectuoso y aveces la pc no encendía, también le agregue un disco duro, le cambie la fuente de poder porque se daño, y revise con el manual de la MoBo como iba el supuesto cable. Ahora no soy muy experto en la materia, pero yo instale el linux compartido con windows para conocer otra pespectiva, y cuando yo hago shutdown desde linux la pc no se me reinicia se apaga correctamente, lo que me da como conclusión que deber ser problema de software y no hardware.
Que creen Uds.?

, se que son muchas cosas que le he hecho a la máquina pero no se
Gracias y Saludos