Si efectuás el marcado HTML según los estándares, no te será difícil ir implementando las pautas de accesibilidad Web.
En cuanto a algunas utilidades para accesibilidad, podés consultar en este mismo foro:
Test de accesibilidad on-line
Que es un post que reúne varias herramientas.
Pero es muy cierto, que las pautas deben verificarse en forma manual; estas aplicaciones sólo te mostrarán si estás llevando a cabo bien el trabajo pero no te certificarán.
En cuanto a W3C y WAI, en forma
muy resumida:
W3C es un consorcio internacional conformado por varios sectores para establecer las pautas y recomendaciones en la Web (teniendo por misión, desarrollar su máximo potencial)
WAI es la iniciativa a accesibilidad Web conducida por W3C y conformada por varios grupos y organizaciones que establecen recomendaciones y recursos para que la Web sea accesible inclusive para personas con algún tipo de incapacidad.
Saludos!