Hola krlos_jr,
En primer lugar, para abrirlo en ventana nueva añadele al link el texto:
target="_blank"
El cambio del link puede ser porque tengas establecida una etiqueta <BASE> en la cabecera del documento cargado en iframe.
Verifícalo.
http://www.********.com/ganar/alta?Id=64601668
<a href="http://www.********.com/ganar/alta?Id=64601668">
<img src="http://www.********.com/muestra_banner?c=64601668109" border=0></a>