Hola LaN~...
Pues puedes hacer lo siguiente:
A la carpeta de tu servidor donde van a quedar alojados dichos archivos, le das click derecho y picas en la opcion propiedades, en algún lugar, no recuerdo bien
podrás asignarle manualmente o mediante checkbox, dependiendo de tu programa FTP, el permiso 777.
De esa manera ya te queda con permiso de escritura por lo que ya podrás subir tus archvos...
De todas formas te dejo el enlace para que mires lo del
chmod
Saludos
