Hola, si haces las subpreguntas con un popup podrias hacer lo siguiente, cuando le des a la pregunta para las subpreguntas creas un popupchild el cual le pasas el id de la pregunta y en base a ella generas las subpreguntas cuando le des el boton agregar o aceptar este haga que te actualice un campo hyden en la ventana de preguntasa lo cual llevarias como un array de las preguntas y subpreguntas del mismo para luego procesarlas como las vayas a procesar..
