Pues lo que te decía... una vez sepas cómo hacer los virtualhost (es buena idea que instales apache en tu portátil para ir practicando, puedes basarte en esta guía:
http://servidor.hostrocket.com), pues tienes que copiar la configuración en el servidor. Pero el cómo acceder al servidor lo sabrás tú mejor que yo... si es contratado con alguna empresa de hosting deberías tener un panel de control o algo que te deje acceder, o si no tienes nada, directamente comenta a los responsables de esa empresa los cambios que quieres hacer. Pero ten en cuenta que no sé cómo lo tienes ahora... y por FTP olvídalo, necesitas un acceso de otro tipo (SSH, panel de control, llamar por teléfono a quien te administre el servidor, etc.)