No sé cómo lo tendréis ahora mismo, pero si usas apache es relativamente sencillo, puedes meter todos los sitios web que quieras usando los virtualhosts. Eso sí, para acceder a la configuración de apache no lo puedes hacer por ftp, necesitas un acceso ssh o un panel de control que te permita manejar el servidor, pues necesitas tanto cambiar los archivos de configuración como reiniciar el apache para que tome los cambios...
