Hola:
¿"Multiplicar" no es otra manera de fusionar capas? Osea en el recuadro donde aparecen todas las capas listadas (ventana>capas ó F7) hay una lista desplegable donde podemos elegir la manera de fusionar dicha capa (Normal, Disolver, Oscurecer, Duplicar...).
La opción multiplicar creo que tiene el mismo efecto que si guardas una imagen como PNG (con canal ALFA) y la insertas en tu documento. Mantendrá lo que haya detrás, pero lo modificará añadiendo información de color almacenada en tu imagen. Creo que es a eso a lo que te estás refiriendo.
¿He acertado?
Si no, entonces creo que necesitamos un par de pistas de photoshop