saludos, he econtrado este programa que te va a venir bastante bien para lo que mencionas: Cobian Backup es una pequeña utilidad que te permite realizar copias de seguridad de ficheros y carpetas, y guardarla en tu disco duro local o alguna otra unidad de red.
Puedes configurar el programa para que haga una copia regularmente cada cierto tiempo. Soporta protocolos de compresión de archivos, mediante el uso del algoritmo ZIP y se puede proteger con contraseña.
en esta dirección de softonic te lo puedes bajar:
http://www.educ.umu.se/~cobian/programz/cbSetup.exe