Coloca el menú horizontal y el contenido dentro de una capa llamada contenedor, por ejemplo.
A las capas cabecera, contenedor y pie, coloca los siguientes atributos:
position:relative; display:block; clear:both;
Ahí debería funcionar.
Si por casualidad las capas contenido y menu lateral son flotantes (tienen definidas propiedades float:left; y float: right;) vas a tener que colocar el siguiente div justo antes de cerrar la capa contenedor:
<div style="width:100%; clear:both;"> </div>