Hola, vas al Panel de Control->Dispositivo de sonido y audio->Sonidos y donde dice
Beep predeterminado eliges
Ninguno.
Probablemente al desactivar este sonido se active el beep del PC, para desactivarlo vas a Inicio->Ejecutar, escribes
regedit presionas la tecla Enter y vas a esta clave de registro:
HKEY_CURRENT_USER\Control Panel\Sound
A tu derecha verás un valor
Beep que por defecto tiene asignado
yes debes cambiar este valor por
no, reinicias el sistema y verifica los resultados.
Saludos