Mysql ... el IN lo soporta en todas las versiones ...
Lo que no soporta Mysql 3.23.51 hacia abajo (version actual estable a fecha del post) son las Subconsultas como parece que estas intentando usar...
Las subconsultas dicen en Mysql que seran posible hacerlas a partir de la version 4.0.2 de la cual ya puedes ir bajando .. pero está todavia en fase de desarrollo ...
mas info:
<a href='ir.asp?http://www.mysql.com/downloads/mysql-4.0.html' target='_blank'>http://www.mysql.com/downloads/mysql-4.0...</a>
Aquí tienes el "multi-table" DELETE de la version 4.0.x:
<a href='ir.asp?http://www.mysql.com/doc/en/DELETE.html' target='_blank'>http://www.mysql.com/doc/en/DELETE.html...</a>
Un saludo,