Si ese es el motivo, mejor usa el Shrink y mételo en un solo DVD, y olvidate de problemas, que no es así como dices, la estructura de un DVD no es poner o quitar archivos, todo va integrado y en secuencia con todo lo demás, si quitas algo deja de funcionar todo correctamente.
El Shrink tiene la capacidad de ajustar los DVD's al tamaño de un DVD de 4.7 manteniendo toda la estructura
