Hola,
Bueno, si no tienes experiencia previa manejando servidores, puede ser bastante difícil empezar desde cero, pero nunca imposible

. Aquí te dejo un manual que te permitirá saber algunas cosas sobre WHM:
http://www.cpanel.net/docs/whm/
Pero eso es solo la parte "visual", lo gráfico de un server cPanel, hay mucho más, y eso implica maneo del Shell (la consola que manejas en sistemas basados en unix). Para interiorizarte en el manejo del shell, te sugiero leer el manual que existe en
http://zonasiete.org
Con estudio, dedicación y paciencia podrás lograrlo

, pero no de un día para otro, te llevará un tiempo considerable.
Saludos,