Yo no utilizo aplicaciones prefabricadas para hacer webs, lo único que uso en prefabricado son los foros y para algún que otro comercio electronico (oscommerce), el resto de las páginas me las hago yo a medida.
Sólo use PHP-NUKE al principio, sobre el 2002 que fue cuando empecé a crear páginas webs, y desde entonces no he vuelto a usar prefabricados.
Por lo que no te puedo decir exactamente que configuración tienen que tener los archivos del PHP-NUKE, supongo que en el "manual" de instalación que suele venir con dichas aplicaciones, te dirá como tienes que ponerlos.
Al tema de la base, suponiendo que se aya caido el servidor, por mucho que intentaras crear una nueva no te deajaria, ya que no dispondrías del acceso.
Me instalaré el PHP-NUKE en mi servidor de pruebas para futuras contestaciones, como hice con Joomla, SMF y Wordpress, porque era la unica manera de poder ayudar a dar respuestas.
