Hola, fijate que estas poniendo dos bodys uno debajo del otro
Deberia quedarte asi:
<html>
<head>
<title>Titulo</title>
<script type="text/javascript">
function abrir() {
popup=window.open("http://unapagina.php/", "popup", "")
popup.close();
window.open("http://www.eso.4d2.net/", "nueva", "");
}
</script>
</head>
<body onload="abrir()">
</body>
</html>
saludos
