No creo que puedas hacer eso que requieres, no existe autoload para funciones, esta diseñado exclusivamente para clases.
Lo mas que podrias hacer es incluirlas tu mismo, o pasarlas a un objeto estatico, y de ahi si cargarlas, por decir si tienes una funcion:
Código PHP:
function algo() {}
Pasarlas a un objeto estatico:
Código PHP:
class objeto {
public static function algo() {}
}
Entonces en ese caso si podrias auto-incluir la clase y llamar a tus funciones asi: objeto::algo();
Saludos.