que tal. io te sugeriria que utilizaras splite, por ejemplo:
Código HTML:
f1= '2007.08.28';
f1 = f1.split('.');
f1 = f1[0]+'-'+f1[1]+'-'+f1[2];
alert('nuevo Formato : ' + f1);
// nuevo Formato : 2007-08-28
espero eso te ayude, suerte!!! y nos cuentas que tal te fue...