Hola:
En principio, jsp significa java server pages, y no tiene mucho que ver con javascript...
Cuando se crean elementos DOM con javascript, si usas variables globales (declaradas fuera de las funciones) siempre serán accesibles, pero también se puede asignar un id y tendrás acceso al nodo dentro del documento con getElementById()... ese nodo siempre debe ser único... otra posibilidad es desde el sitio donde se añaden (ya sea con appendChild como con insertBefore) obtener la lista de hijos (childNodes) y recorrerlas con un bucle for...
Saludos
