Hola jordiarte...
Mira yo la verdad de javascript no sè es pero un pelo, pero si sè la inseguridad que tiene las tecnologìas del lado del cliente como es javascript, con solo que te lo desactiven tu aplicaciòn se fue al piso...
No sè si esto se pueda solventar con AJAX la verdad... tal vez alguien que sea fuerte en este tema puede entrar a ayudarte...
Lo ùnico que yo digo es que para el tipo de aplicaciòn que quieres hacer, javascript no serìa para mi una opciòn, ni siquiera lo pensarìa, para ese tipo de aplicaciones lo harìa del lado del servidor, osea php, asp...
Saludos