Eso no es del todo cierto masterparaiso, algunas veces toma el URL .htm como .php como parte de la búsqueda.
Por ejemplo si buscamos (php y xml manual)
http://www.google.com.pe/search?hl=e...G=Buscar&meta=
Verás que resalta los url que tienen .php como si fuera parte de los resultados.
Ultimamente creo que es mejor tenerlos sin extensión, ya que brinda la ventaja de que si cambias de lenguaje de programación (php, jsp, asp.net) no va a afectar los URLs y perder posiciones en los buscadores.
Saludos