Según he estado leyendo aumenta la seguridad pues el javascript se ejecuta en la máquina del cliente y por tanto los datos que se han de enviar a traves de de la red de internet ya están encriptados.
Evidentemente la seguridad nunca es total pero te dejo uno de los artuculos que me convenció a usar este método.
http://www.minelinks.com/supercode/js_info_es.html