hojolaaaa, el nombre de la carpeta no tiene nada que ver, es un problema de especificar bien la ruta y nada mas, a ver, si tienes que incluir la coneccion en la pagina index, por ejemplo, que por su puesto esta en la raiz del sitio, lo haces asi:
Código PHP:
<?php require_once('carpeta/coneccion.php'); ?>
de lo contrario si tienes que salir de un directorio y entrar en otro (subir y bajar en tu arbol del directorio) usas ../ para subir y el nombre de la carpeta para entrar, algo asi:
Código PHP:
<?php require_once('../carpeta/coneccion.php'); ?>
saludos y suerte
PD: esto es mas bien un tema que se llama rutas relativas, existen las rutas relativas al sitio y las rutas relativas al documento