¿Y estás seguro de que podías quitarlo sin problemas? Imagino que dado que tienes repositorios de una sola rama, no deberías tener problemas, pero quizás habría sido preferible que hicieras una copia de respaldo del archivo, por si acaso.
PD: Antes, al buscar soluciones, tropecé con la misma pregunta planteada por ti en
otro foro. Sería conveniente que te pasaras por allí a explicar cómo lo has solucionado, para que cuando alguien tenga el mismo problema se encuentre con la solución.