Esos mismos problemas he experimentado en mis pruebas con la versión 11 de cpanel.
Lo he solucionado solo actualizando la configuración de cada reseller, ingreso a editar sus cuentas y las grabo, NADA MAS.
Es por eso que con esta versión la considero de prueba y no la tengo generalizada.
Cita:
Iniciado por Apolo 
WHM (root) -> Resellers -> Reseller Center -> Select a Reseller -> Edit Privileges/Nameservers -> Seleccionar la casilla Disallow creation of accounts with packages that are not global or not owned by this user.
Pero claro, aún no se ha dicho claramente si tiene privilegios de administrador o no.
Si los tiene, allí está la solución.
Si no los tiene, ¿en dónde está el "soporte"?
Saludos,