En photoshop...
Si no has cerrado la imagen puedes hacerlo con el pincel historia, te dejo un ejemplo que han puesto estos días...
http://www.forosdelweb.com/f6/pincel-historia-photoshop-505601/
Si la has cerrado, pero conservas el original, puedes copiar la original encima de la modificada e ir borrando lo que no te interese. O usar una máscara de capa.
En Gimp ni idea no lo he usado nunca, puede que tenga herramientas similares ¿?
Saludos,
suerte